本赛季的亚冠联赛当中，总共有4支来自J联赛的球队参加了小组赛，他们分别是进入F组的浦和红钻、进入H组的横滨水手、进入I组的川崎前锋以及进入J组的神户胜利船，其中，浦和红钻是以上赛季天皇杯冠军的身份进入亚冠赛场的，其余三支球队则是上赛季日本J联赛排名前三。那么，他们有谁进入了亚冠淘汰赛当中呢？
浦和红钻与韩国的大邱、新加坡超级联赛的狮城水手以及山东泰山同组，尽管成绩同为4胜1平1负且净胜球更多，但由于与大邱的相互战绩不占优势，他们最终位列小组第二，但还是成功晋级到了淘汰赛阶段，他们接下来的对手是来自马来西亚的柔佛新山。
横滨水手与韩国老牌劲旅全北现代、越南球队嘉莱黄英以及澳超悉尼FC同组，由于后两者实力较弱，基本是日韩两支球队“二人转”，横滨水手在6轮战罢后以1分优势力压全北现代占据小组头名，两者携手出线，而横滨的下一个对手是同样来自J联赛的神户胜利船。
与联赛当中的颓势不同，从亚冠资格赛打起的神户可谓一路过关斩将，在上海海港退出亚冠后，J联赛季军成为了小组当中实力最强的球队，港超的杰志和泰超的清莱联显然无法阻止他们，神户成功夺得小组第一出线，并将于横滨水手展开J联赛内战。
J联赛唯一爆冷出局的是上赛季联赛冠军川崎前锋，由于与蔚山现代的比赛一平一负，他们最终被马来西亚球队柔佛新山甩开两分的差距无缘小组出线，不过在回到国内赛场后，他们再次领跑积分榜，本赛季有望实现联赛卫冕。
